При приобретении товаров комиссионером в момент перечисления денежных средств поставщику в оплату их стоимости у комиссионера согласно п. 4.7 Закона об НДС возникает право на налоговый кредит по НДС (на основании полученной от поставщика налоговой накладной, выписанной на имя комиссионера).
На дату передачи таких товаров комитенту у комиссионера возникают налоговые обязательства по НДС, в подтверждение которых комиссионер на имя комитента выписывает налоговую накладную.

В результате этого у комиссионера ранее отраженна налоговый кредит «перекрывается» налоговыми обязательствам Полученной от комиссионера налоговой накладной комитент по утверждает свое право на налоговый кредит. Что касается суммы комиссионного вознаграждения, по первому событию (получению денежных средств от комитент или подписанию акта выполненных работ) у комиссионера возникают налоговые обязательства, по НДС исходя из стоимость предоставленных услуг. В подтверждение таких налоговых обязательств он выписывает налоговую накладную на имя комитента что дает право последнему на отнесение суммы НДС в налоговый кредит.

Налоговый учет
Налоговый учет розничных комиссионных операций во много аналогичен налоговому учету операций по договорам комиссии на продажу (рассмотренному выше), однако имеет и свои особенности.
Налог на прибыль. Порядок обложения налогом на прибыль комиссионных операций в розничной торговле принципиально ничем не отличается от порядка налогообложения комиссионных операций в рамках других договоров комиссии на продажу. Так:

— передача товара от комитента к комиссионеру не влечет за собой никаких последствий в налоговом учете сторон;

— при продаже товара валовой доход возникает у комитента (комитент его отражает на основании отчета комиссионера по первому из событий комиссионера — отгрузке товара покупателям или получению от покупателей денежных средств);

— комиссионер отражает валовой доход исходя из суммы комиссионного вознаграждения (без НДС) по первому из событий (подписанию акта выполненных работ или получению комиссионного вознаграждения от комитента); соответственно на сумму комиссионного вознаграждения (без НДС), причитающегося комиссионеру, комитент (по первому из событий) увеличивает валовые расходы.