Порядок налогового учета у комиссионера по договорам комиссии с нерезидентом аналогичен порядку налогообложения операций по договору комиссии на продажу товаров (работ, услуг) на территории Украины. Передача товаров комиссионеру для последующего вывоза (экспорта) за пределы таможенной территории Украины, а также продажа указанного товара нерезиденту на обложение или необложенне налогом на прибыль комиссионера не влияет (в налоговом учете не отражаются).

Также комиссионера (в отличие от комитента) не затрагивают учет курсовых разниц по валютной задолженности и учет балансовой стоимости валюты по посредническим операциям, т. е. в налоговом учете комиссионера такие суммы не отражаются. Валовой доход возникает у комиссионера, только исходя из суммы комиссионного вознаграждения (по первому из событий — подписанию акта выполненных работ или получению вознаграждения от комитента).

По поводу возмещения затрат комиссионера по исполнению сделки (например, сумм, уплачиваемых при таможенном оформлении товара), заметим, что они включаются в состав валовых расходов комитента на основании отчета комиссионера как расходы, связанные с ведением хозяйственной деятельности. Однако в налоговом учете комиссионера такие суммы не отражаются (денежные средства проходят через комиссионера транзитом).

НДС. Начиная с 31.03.2005 г. после внесения изменений Законом № 2505 в Закон об НДС при обложении НДС внешнеэкономических посреднических операций нужно учитывать требования п. 4.7 Закона об НДС.
В связи с этим некоторые специалисты склоняются к мнению, что гораздо безопаснее комиссионеру вообще не отражать никаких налоговых последствий по НДС при экспорте товара. То есть они трактуют нормы Закона об НДС следующим образом: несмотря на то что экспортером по такому договору выступает комиссионер, право на нулевую ставку по НДС по такой операции имеет комитент, и именно комитент должен отражать эту операцию в учете НДС как экспортную.